RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 POU2F2P09086 479 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 TIMP2P16035 220 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 DGKAP23743 735 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ETV3P41162 512 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN5P54829 565 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 NME5P56597 212 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 GRB7Q14451 532 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SQLEQ14534 574 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP6Q16828 381 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 AGKQ53H12 422 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PGM2L1Q6PCE3 622 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SCIMPQ6UWF3 145 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 DLG3Q92796 817 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ASB16Q96NS5 453 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 EBF2Q9HAK2 575 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PRRT4C9JH25 899 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 CFLARO15519 480 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 GNAZP19086 355 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 HERC3Q15034 1050 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ACOX2Q99424 681 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PQ67 120 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ESRRBO95718 433 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 HLA-EP13747 358 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 VIPR1P32241 457 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 OR56A4Q8NGH8 313 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SAMD11Q96NU1 681 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 TBX10O75333 385 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 FSHRP23945 695 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 AKT1P31749 480 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 METAP1P53582 386 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PAOXQ6QHF9 649 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 HIPK4Q8NE63 616 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SMARCD2Q92925 531 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 POLG2Q9UHN1 485 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ITM2BQ9Y287 266 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 OR4F21O95013 312 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 MLYCDO95822 493 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 CCR7P32248 378 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ST8SIA6P61647 398 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ART3Q13508 389 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 WLSQ5T9L3 541 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 CDYL2Q8N8U2 506 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 EGFL8Q99944 293 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 EYSQ5T1H1 3165 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 EPOPA6NHQ4 379 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 GIPC1O14908 333 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 RAD51BO15315 384 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 HSPA7P48741 367 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 CREB5Q02930 508 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 KIF19Q2TAC6 998 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 CDRT15Q96T59 188 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PBX4Q9BYU1 374 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SARDHQ9UL12 918 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 POMPQ9Y244 141 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 GDF5P43026 501 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ERVPABLB-1P60509 514 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PTK2BQ14289 1009 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 GRIN2CQ14957 1233 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 C16orf89Q6UX73 402 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 RNF148Q8N7C7 305 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 WDR41Q9HAD4 459 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms