RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 FMO5P49326 533 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 CXCL9Q07325 125 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 RAB6CQ53S08 254 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SCML4Q8N228 414 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.07□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 GIMAP4Q9NUV9 329 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 AMACRQ9UHK6 382 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 HACL1Q9UJ83 578 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 C5orf60A6NFR6 353 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 IFITM10A6NMD0 228 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 NDUFS4O43181 175 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 XPNPEP2O43895 674 aa4.06□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 NNMTP40261 264 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 HSD17B4P51659 736 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 STAT2P52630 851 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 KLHL22Q53GT1 634 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 KRT79Q5XKE5 535 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ALS2CLQ60I27 953 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SEMA4DQ92854 862 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ZNF583Q96ND8 569 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 CDRT15Q96T59 188 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 CENPOQ9BU64 300 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.06□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 POLG2Q9UHN1 485 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 YIPF1Q9Y548 306 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PS18 150 aa4.05□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 PLXDC2Q6UX71 529 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GDPD4Q6W3E5 623 aa4.05□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 GALNT5Q7Z7M9 940 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 KCNK15Q9H427 330 aa4.05□□□□□ -1.76
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RBM39-211ENST00000426951 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 DVL1O14640 695 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ADAM20O43506 726 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GCNT3O95395 438 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 CRYAAP02489 173 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 TFAP2AP05549 437 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 VPREB1P12018 145 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MCCP23508 829 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 RAD52P43351 418 aa4.04□□□□□ -1.76
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