RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425239.5

ATG4B-209, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-209ENST00000425239 RFPL1O75677 317 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 MT-ND3P03897 115 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 NTRK1P04629 796 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 TMEM253P0C7T8 217 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UGT1A6P19224 532 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UGT1A1P22309 533 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UGT1A4P22310 534 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 ADCY2Q08462 1091 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 MESDQ14696 234 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 METRNLQ641Q3 311 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 IRGCQ6NXR0 463 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 D2HGDHQ8N465 521 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UBXN4Q92575 508 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 MAP3K3Q99759 626 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 ACTL8Q9H568 366 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UBP1Q9NZI7 540 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 BLACEA4D250 179 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 APOL1O14791 398 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 PMPCBO75439 489 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 EPOP01588 193 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 SLC4A1P02730 911 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 EBLN1P0CF75 366 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 CHRNA4P43681 627 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UQCRFS1P47985 274 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 CHRNA6Q15825 494 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 UGT8Q16880 541 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 LRRC38Q5VT99 294 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 AMZ2Q86W34 360 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 DNAJC7Q99615 494 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 GPR87Q9BY21 358 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 PDE7BQ9NP56 450 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 SPTBP11277 2137 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-209ENST00000425239 PCSK5Q92824 1860 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 SGTAO43765 313 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 PTPN4P29074 926 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 ARHGAP25P42331 645 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 TUBB3Q13509 450 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 IL10RAQ13651 578 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 NFE2L1Q14494 772 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 LCN10Q6JVE6 187 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 KMT5CQ86Y97 462 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 TRABDQ9H4I3 376 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 FGF21Q9NSA1 209 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 IFNKQ9P0W0 207 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 RARRES3Q9UL19 164 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 ITPR2Q14571 2701 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 OR5K3A6NET4 321 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 CEACAM4O75871 244 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 CAPN1P07384 714 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 VCLP18206 1134 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 CDKN2BP42772 138 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 NR2C2P49116 596 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 WNT3AP56704 352 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 GPS2Q13227 327 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 PTPRCAPQ14761 206 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 TCEAL1Q15170 157 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-209ENST00000425239 CPZQ66K79 652 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms