RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 C1SP09871 688 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 MTHFD2P13995 350 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 ARSAP15289 507 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF30P17039 623 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 CTPS1P17812 591 aa5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 LHCGRP22888 699 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 KRT72Q14CN4 511 aa5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 TCEAL5Q5H9L2 206 aa5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 MACC1Q6ZN28 852 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 ASRGL1Q7L266 308 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 PIM3Q86V86 326 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 SERPINA9Q86WD7 417 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 GPR26Q8NDV2 337 aa5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 CD200R1Q8TD46 325 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 PPP4R1Q8TF05 950 aa5.96□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 CNDP1Q96KN2 507 aa5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 ELOVL2Q9NXB9 296 aa5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.96□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 CHD7Q9P2D1 2997 aa5.95□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 COL4A3Q01955 1670 aa5.95□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 FAM170BA6NMN3 283 aa5.95□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.95□□□□□ -1.46
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C6orf48-208ENST00000395788 LINC01565O15544 149 aa5.95□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 GRID2O43424 1007 aa5.95□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 OR1I1O60431 355 aa5.95□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 KERAO60938 352 aa5.95□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 VPS26AO75436 327 aa5.95□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 LEFTY1O75610 366 aa5.95□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 RHOBTB1O94844 696 aa5.95□□□□□ -1.46
C6orf48-208ENST00000395788 TIAF1O95411 115 aa5.95□□□□□ -1.46
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