RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 NUS1Q96E22 293 aa15.13■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ERVK-6Q9BXR3 956 aa15.13■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RAD18Q9NS91 495 aa15.13■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ASB1Q9Y576 335 aa15.13■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC189A1A4V9 331 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 IGLON5A6NGN9 336 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 MATN2O00339 956 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 DIAPH2O60879 1101 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 AOAHP28039 575 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CTSCP53634 463 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 NFKB2Q00653 900 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SH2D4BQ5SQS7 431 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 AGBL4Q5VU57 503 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 EPGNQ6UW88 154 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FRMD7Q6ZUT3 714 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 VRK3Q8IV63 474 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CXorf40AQ8TE69 158 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 WWP1Q9H0M0 922 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ARMCX1Q9P291 453 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FAM8A1Q9UBU6 413 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 HAO1Q9UJM8 370 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PPC1 479 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PQF6 199 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8OA6NCC3 632 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM202A6NGA9 273 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SHISA7A6NL88 538 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8NF8WBI6 632 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FCHO1O14526 889 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 T-ENOLP0DO92 83 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 HSPA14Q0VDF9 509 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TGFBIQ15582 683 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CYP2U1Q7Z449 544 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 VPS35Q96QK1 796 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PANX3Q96QZ0 392 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 NUF2Q9BZD4 464 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CD274Q9NZQ7 290 aa15.12■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GTL3 188 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 KLK8O60259 260 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEC1O60732 1142 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PCDH8O95206 1070 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CBX6O95503 412 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GPR1P46091 355 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RGS4P49798 205 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CORO7P57737 925 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SH3BP2P78314 561 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CREB5Q02930 508 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CUZD1Q86UP6 607 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 MYO1HQ8N1T3 1032 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 KLK6Q92876 244 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 OR52B2Q96RD2 323 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GABRG3Q99928 467 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TRPV5Q9NQA5 729 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD5Q9NXV2 234 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SYCE1LA8MT33 242 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 NPC1O15118 1278 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GUCA1CO95843 209 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 C5AR1P21730 350 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PHKG1Q16816 387 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC6AQ6EIG7 209 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SDE2Q6IQ49 451 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 OR2T3Q8NH03 318 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RAB7BQ96AH8 199 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms