RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NR4A2P43354 598 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF81P51508 661 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARSEP51690 589 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLCNKAP51800 687 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC00205P59089 165 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NFE2L1Q14494 772 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HYAL4Q2M3T9 481 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CBWD6Q4V339 395 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCP11X2Q5H9J9 407 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CBWD3Q5JTY5 395 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FRG2Q64ET8 278 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C11orf87Q6NUJ2 197 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYCE2Q6PIF2 218 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 BRAT1Q6PJG6 821 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR180Q86V85 440 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SATL1Q86VE3 508 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HACE1Q8IYU2 909 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEP57L1Q8IYX8 460 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC38A9Q8NBW4 561 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR5M8Q8NGP6 311 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEMA4DQ92854 862 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 EXOC4Q96A65 974 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SH3GL2Q99962 352 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KATNB1Q9BVA0 655 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUP85Q9BW27 656 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAGIXQ9H6Y5 334 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q9N2K0 584 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYNNQ9NPC7 610 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 EQTNQ9NQ60 294 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCM9Q9NXL9 1143 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTTG2Q9NZH5 202 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPAP1Q9NZP6 1156 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TUBE1Q9UJT0 475 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OSGIN1Q9UJX0 560 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYO6Q9UM54 1294 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIPGQ9Y5X9 500 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPRCP08575 1304 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGEF37A1IGU5 675 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR5K3A6NET4 321 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKUB1A6NFN9 424 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF587BE7ETH6 402 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLIC2O15247 247 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNN4O15554 427 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NDUFS4O43181 175 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR10H2O60403 315 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNJ13O60928 360 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBCAO75347 108 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MOSPD3O75425 235 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC175P0C221 793 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCF4P15884 667 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PFKFB1P16118 471 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACHEP22303 614 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NR2F2P24468 414 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GP5P40197 560 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSMC4P43686 418 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNJ1P48048 391 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIRPAP78324 504 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DMPKQ09013 629 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLA2G7Q13093 441 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP2R5CQ13362 524 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OASLQ15646 514 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CST9LP1Q5W188 147 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT39Q6A163 491 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GFRALQ6UXV0 394 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHST3Q7LGC8 479 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMPRSS11BQ86T26 416 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIM3Q86V86 326 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLCCI1Q86VQ1 547 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM219Q86XT9 240 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCEMP1Q8IX19 187 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1orf87Q8N0U7 546 aa2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms