RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SORCS1Q8WY21 1168 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LPGAT1Q92604 370 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC14Q96N46 770 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEUROD6Q96NK8 337 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCNAQ96QF7 691 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUBA1CQ9BQE3 449 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL4Q9C0H6 718 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FKRPQ9H9S5 495 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL1Q9NR64 748 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCF3Q9NUQ8 709 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAB2Q9NYJ8 693 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLIC5Q9NZA1 410 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL9Q9P2J3 617 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM169AQ9Y6X4 670 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PPE2 198 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PR64 198 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 C15orf62A8K5M9 175 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEB17A8MXT2 336 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TULP2O00295 520 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAMEF11O60813 436 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LDB3O75112 727 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSPG5O95196 566 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZWINTO95229 277 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 BMP10O95393 424 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL11P20809 199 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCCP23508 829 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DGKAP23743 735 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 AHRP35869 848 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAS1P54826 345 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLLT10P55197 1068 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE2BQ13066 116 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLA2G7Q13093 441 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM266Q2M3C6 531 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE2EQ4V326 116 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB6CQ53S08 254 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 STXBP5Q5T5C0 1151 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GARNL3Q5VVW2 1013 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALS2CLQ60I27 953 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADALQ6DHV7 355 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE2AQ6NT46 116 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM171BQ6P995 826 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC9B2Q86UD5 537 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GBGT1Q8N5D6 347 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LSMEM1Q8N8F7 131 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 POMGNT2Q8NAT1 580 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 AVL9Q8NBF6 648 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA20Q8TB22 786 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBC1D16Q8TBP0 767 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMCO6Q96DC7 493 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINGO1Q96FE5 620 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DGAT2Q96PD7 388 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDRT15Q96T59 188 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TXLNGYQ9BZA5 131 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB6CQ9H0N0 254 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP27Q9H306 513 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNK15Q9H427 330 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 EVA1AQ9H8M9 152 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLG2Q9UHN1 485 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2M5A3KFT3 312 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASPDHA6ND91 283 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAC2D3DTV9 90 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 BUB3O43684 328 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE9AO76083 593 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCL10O95999 233 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNTTP04053 509 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADRB2P07550 413 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT19P08727 400 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF23P17027 643 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FMO5P49326 533 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FUT6P51993 359 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TERF1P54274 439 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBXN2AP68543 259 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TROAPQ12815 778 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MELKQ14680 651 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIRPB2Q5JXA9 342 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 WBP2NLQ6ICG8 309 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM211Q6ICI0 200 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PACS1Q6VY07 963 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT74Q7RTS7 529 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXOC3L1Q86VI1 746 aa2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms