RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UGT1A6P19224 532 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 MSH3P20585 1137 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 IDSP22304 550 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UGT1A1P22309 533 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UGT1A4P22310 534 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CA5AP35218 305 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UGT1A3P35503 534 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 DRG2P55039 364 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GDF10P55107 478 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GNG11P61952 73 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PDE1BQ01064 536 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 VAC14Q08AM6 782 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SPARCL1Q14515 664 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 P3H1Q32P28 736 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf22Q6V702 233 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AMZ2Q86W34 360 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FAM129CQ86XR2 697 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 NCSTNQ92542 709 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 USP7Q93009 1102 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PMEPA1Q969W9 287 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TLR10Q9BXR5 811 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UCK1Q9HA47 277 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 RNF14Q9UBS8 474 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KCTD3Q9Y597 815 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FLNCQ14315 2725 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 OR2AG2A6NM03 316 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 EFCAB7A8K855 629 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 A8MU76 341 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 CEP104O60308 925 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 UBXN7O94888 489 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 METTL18O95568 372 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 FGGP02679 453 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 BRAFP15056 766 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ITGALP20701 1170 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 CD82P27701 267 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 HADHAP40939 763 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 SLC19A1P41440 591 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 HALP42357 657 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 CAPZBP47756 277 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 CTSCP53634 463 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 DMPKQ09013 629 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 SEPT6Q14141 434 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 TGIF1Q15583 401 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 CCNG2Q16589 344 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 PARP6Q2NL67 630 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 KCTD11Q693B1 232 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM26Q6ZUK4 368 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 DET1Q7L5Y6 550 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC89Q8N998 374 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF398Q8TD17 642 aa7.52□□□□□ -1.21
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