RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 GALNT7Q86SF2 657 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 DNAJC19Q96DA6 116 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 MID1O15344 667 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 AIREO43918 545 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 CLDN11O75508 207 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 HSPA7P48741 367 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 AIF1P55008 147 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 HSPB3Q12988 150 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 DGKZQ13574 1117 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.144e-7■■■□□ 14.9
RXRA-201ENST00000356384 PPM1JQ5JR12 505 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 UNC5BQ8IZJ1 945 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 ZNF567Q8N184 647 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 SLC44A1Q8WWI5 657 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 CDH7Q9ULB5 785 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.91■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 STBD1O95210 358 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 RASGRP1O95267 797 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 P2RY8Q86VZ1 359 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 FBXL16Q8N461 479 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 CNTNAP1P78357 1384 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 IRF6O14896 467 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 SPAM1P38567 509 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 GRM5P41594 1212 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 MAPK12P53778 367 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 DDR1Q08345 913 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 NOMO1Q15155 1222 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 B3GALT6Q96L58 329 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 ZNF570Q96NI8 536 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 GAL3ST4Q96RP7 486 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 PTPN18Q99952 460 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 EBPLQ9BY08 206 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 TESMINQ9Y4I5 508 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 OR2AG2A6NM03 316 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 hCG_2039718K7EN88 272 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 KLRC4O43908 158 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 MSCO60682 206 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 GLUD1P00367 558 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 C1RP00736 705 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 BTN3A2P78410 334 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 TAF10Q12962 218 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 CBR4Q8N4T8 237 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 PPP1R14BQ96C90 147 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 SIPA1Q96FS4 1042 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 MIOSQ9NXC5 875 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 RAB26Q9ULW5 256 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 MED31Q9Y3C7 131 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 SNX4O95219 450 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 TLR1Q15399 786 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 C9orf57Q5W0N0 161 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 NAT14Q8WUY8 206 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 TMEM165Q9HC07 324 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 C5orf60A6NFR6 353 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 OR6C75A6NL08 312 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 LGR5O75473 907 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 OR7A10O76100 309 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 HOXC12P31275 282 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 ADAM17P78536 824 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 PYHIN1Q6K0P9 492 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 ANKRD46Q86W74 232 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 BTN2A3PQ96KV6 586 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
RXRA-201ENST00000356384 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TLL1O43897 1013 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MFSD11O43934 449 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CCNB2O95067 398 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MAZP56270 477 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CACNG1Q06432 222 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 DACT2Q5SW24 774 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 USP30Q70CQ3 517 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 LRRC52Q8N7C0 313 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 C11orf65Q8NCR3 313 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ALG3Q92685 438 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CHIAQ9BZP6 476 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TM7SF2O76062 418 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 RPIAP49247 311 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MPP1Q00013 466 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ZMYND11Q15326 602 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MED27Q6P2C8 311 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms