RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 SLC13A1Q9BZW2 595 aa27.35■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 VWA7Q9Y334 891 aa27.35■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 PRKAB1Q9Y478 270 aa27.35■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 SNX11Q9Y5W9 270 aa27.35■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 H3BM21 787 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 NIPSNAP2O75323 286 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 VPS26AO75436 327 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 KRT37O76014 449 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM16O95361 564 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 NME1P15531 152 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 LRP8Q14114 963 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 IL27RAQ6UWB1 636 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 TIMM29Q9BSF4 260 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 TAS2R13Q9NYV9 303 aa27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 USP34Q70CQ2 3546 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 IQCF5A8MTL0 148 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 POP7O75817 140 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 JUNDP17535 347 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 VCLP18206 1134 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 CD9P21926 228 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 SLCO1A2P46721 670 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 POU4F1Q01851 419 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 INSCQ1MX18 579 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 UGT3A1Q6NUS8 523 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 C11orf96Q7Z7L8 435 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 CROCCP2Q86T23 111 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 AMZ2Q86W34 360 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD7Q92527 254 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 FAM86C1Q9NVL1 165 aa27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
GIPC1-201ENST00000345425 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SMIM23A6NLE4 172 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 PATE3B3GLJ2 98 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 KPNA5O15131 536 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 KCNJ13O60928 360 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SYPP08247 313 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SLC12A2P55011 1212 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 BNC1Q01954 994 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 GRIK2Q13002 908 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF542PQ5EBM4 170 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 PLA2G2CQ5R387 149 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 MROH9Q5TGP6 573 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 KRT222Q8N1A0 295 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 OR2L2Q8NH16 312 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 RUFY1Q96T51 708 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 KLF15Q9UIH9 416 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SLC39A10Q9ULF5 831 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 MGAT4DA6NG13 374 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 CTSEP14091 401 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 DCLK2Q8N568 766 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 MTBPQ96DY7 904 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TSPAN17Q96FV3 270 aa27.32■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 VPS13AQ96RL7 3174 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TLDC2A0PJX2 215 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 LMNAP02545 664 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ACP5P13686 325 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ITGB6P18564 788 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 FDXRP22570 491 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP8P85298 464 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF844Q08AG5 666 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 BMPR2Q13873 1038 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 USP10Q14694 798 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 OTOAQ7RTW8 1153 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ELMO1Q92556 727 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 LATS2Q9NRM7 1088 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TM7SF3Q9NS93 570 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TBK1Q9UHD2 729 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 MED16Q9Y2X0 877 aa27.31■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 DFNA5O60443 496 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 SAT1P21673 171 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 CDKN2DP55273 166 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.962e-6■■■■□ 21.4
GIPC1-201ENST00000345425 KRT71Q3SY84 523 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 HM13Q8TCT9 377 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 GPR21Q99679 349 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM168Q9H0V1 697 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL42Q9P2K6 505 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 KNL1Q8NG31 2342 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP33O14559 1287 aa27.3■■□□□ 1.96
GIPC1-201ENST00000345425 DYNC1I1O14576 645 aa27.3■■□□□ 1.96
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