RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 EYSQ5T1H1 3165 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 TRPC5OSA6NMA1 111 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 E9PBE3 544 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 KLHL41O60662 606 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 MSH3P20585 1137 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 CALB2P22676 271 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 WASP42768 502 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 PSMD8P48556 350 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 KCNJ2P63252 427 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 SH3BP2P78314 561 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP8P85298 464 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 ENPP2Q13822 863 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 ANKS6Q68DC2 871 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 CYHR1Q6ZMK1 362 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 ACAD11Q709F0 780 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 CYP2U1Q7Z449 544 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 KIRREL3Q8IZU9 778 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 VPS35Q96QK1 796 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 CDYLQ9Y232 598 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.9■□□□□ 0.62
UPP1-201ENST00000331803 CDK14O94921 469 aa18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 CBSLP0DN79 551 aa18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 IGFBP4P22692 258 aa18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 CBSP35520 551 aa18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 TNFRSF4P43489 277 aa18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 CLCQ05315 142 aa18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 FAM46CQ5VWP2 391 aa18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 HDAC8Q9BY41 377 aa18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 NUDT4Q9NZJ9 180 aa18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 COQ6Q9Y2Z9 468 aa18.89■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 K7EQS6 105 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 PPP6CO00743 305 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 AP2A2O94973 939 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 ENO1P06733 434 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 RPS17P08708 135 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 NQO1P15559 274 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 AOC1P19801 751 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 AOAHP28039 575 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 PTPN4P29074 926 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 P2RY2P41231 377 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 AGTR2P50052 363 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 NAA20P61599 178 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R3AQ16821 1122 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 LDLRAP1Q5SW96 308 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 GLYATL1Q969I3 302 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 MID1IP1Q9NPA3 183 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 BRWD1Q9NSI6 2320 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 NPC1O15118 1278 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 MMP20O60882 483 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 C6P13671 934 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 BTKQ06187 659 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 CNTN1Q12860 1018 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 AAK1Q2M2I8 961 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 TMEM52BQ4KMG9 183 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 CLYBLQ8N0X4 340 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 RAB7BQ96AH8 199 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 CCDC28BQ9BUN5 200 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 OARD1Q9Y530 152 aa18.88■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 RAD51BO15315 384 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 FFAR2O15552 330 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 FGF4P08620 206 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 TIE1P35590 1138 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 SEC13P55735 322 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 LCP2Q13094 533 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 E2F5Q15329 346 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 CLEC6AQ6EIG7 209 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 ESAMQ96AP7 390 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 SLC40A1Q9NP59 571 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 TAGLN3Q9UI15 199 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 CD207Q9UJ71 328 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 PCTPQ9UKL6 214 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD12Q6UB98 2062 aa18.87■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 SGTAO43765 313 aa18.86■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 SATB1Q01826 763 aa18.86■□□□□ 0.61
UPP1-201ENST00000331803 CREB5Q02930 508 aa18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms