RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 WFS1O76024 890 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 GUCA1CO95843 209 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 AKT1P31749 480 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 MMP12P39900 470 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 DCDC1P59894 354 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 WASHC2DQ5SRD0 308 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 DLG3Q92796 817 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PANX3Q96QZ0 392 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF225Q9UK10 706 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PIP5K1BO14986 540 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A2O15244 555 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TM7SF2O76062 418 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 THRAP10827 490 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 NFKBIAP25963 317 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 OPRD1P41143 372 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 RUNX3Q13761 415 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 SYVN1Q86TM6 617 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 WDR60Q8WVS4 1066 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 MYADMQ96S97 322 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TUBB1Q9H4B7 451 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 SMOXQ9NWM0 555 aa22.42■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PRNPP04156 253 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 OR56A5P0C7T3 313 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ITGAXP20702 1163 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 RAP1GDS1P52306 607 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PHKG1Q16816 387 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ERAP2Q6P179 960 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 LIPIQ6XZB0 460 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ULK2Q8IYT8 1036 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 OARD1Q9Y530 152 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TIMM22Q9Y584 194 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 COL4A3Q01955 1670 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.41■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 UBDO15205 165 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 RAD51BO15315 384 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ELFN1P0C7U0 828 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 GJA4P35212 333 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 RBBP7Q16576 425 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 GDF15Q99988 308 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 KXD1Q9BQD3 176 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 RTKNQ9BST9 563 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM245Q9H330 911 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 SUN2Q9UH99 717 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 BTRCQ9Y297 605 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 SPINT1O43278 529 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PEX11AO75192 247 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 MLYCDO95822 493 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 DDIASQ8IXT1 998 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 CPA6Q8N4T0 437 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TRAM1L1Q8N609 369 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PDPRQ8NCN5 879 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ARRDC3Q96B67 414 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 AKTIPQ9H8T0 292 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.4■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 A0A088AWK7 358 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PLK4O00444 970 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 AIM2O14862 343 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 GPC4O75487 556 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 CRCPO75575 148 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ESRRBO95718 433 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 NAA20P61599 178 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ACOX1Q15067 660 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 OR52B6Q8NGF0 335 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 OR56A4Q8NGH8 313 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 CHFRQ96EP1 664 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 SLC7A8Q9UHI5 535 aa22.39■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms