RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.63■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.62■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 MLYCDO95822 493 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 LBX1P52954 281 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 MPP7Q5T2T1 576 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 SPPL3Q8TCT6 385 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 LRCH1Q9Y2L9 728 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 E2F3O00716 465 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 LINC00271P0C7V0 271 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 CAPN3P20807 821 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 GPX3P22352 226 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 DGKAP23743 735 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 NNMTP40261 264 aa16.61■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 GTF2H2Q13888 395 aa16.61■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa16.61■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF15O94989 841 aa16.61■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 PTSQ03393 145 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.255e-7■■■□□ 19.2
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PKN3-201ENST00000291906 KBTBD6Q86V97 674 aa16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 OR2T11Q8NH01 316 aa16.61■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 EPS15L1Q9UBC2 864 aa16.61■□□□□ 0.25
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PKN3-201ENST00000291906 KLQ9UEF7 1012 aa16.6■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 OR2AG2A6NM03 316 aa16.6■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 STX16O14662 325 aa16.6■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 CLGNO14967 610 aa16.6■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 MOSPD3O75425 235 aa16.6■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 LEFTY1O75610 366 aa16.6■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 CEBPBP17676 345 aa16.6■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 TCEAL5Q5H9L2 206 aa16.6■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 TMEM215Q68D42 235 aa16.6■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.6■□□□□ 0.25
PKN3-201ENST00000291906 V9GYQ6 96 aa16.6■□□□□ 0.25
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