RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 OR6C1Q96RD1 312 aa20.66■□□□□ 0.9
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NEDD8-201ENST00000250495 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM4Q9C037 500 aa20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-201ENST00000250495 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-201ENST00000250495 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-201ENST00000250495 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-201ENST00000250495 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-201ENST00000250495 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.66■□□□□ 0.9
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NEDD8-201ENST00000250495 KLHL35Q6PF15 583 aa20.65■□□□□ 0.9
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NEDD8-201ENST00000250495 C16orf46Q6P387 395 aa20.64■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 BBS12Q6ZW61 710 aa20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 TC2NQ8N9U0 490 aa20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF398Q8TD17 642 aa20.64■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 UBXN4Q92575 508 aa20.63■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 KIAA0754O94854 1291 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 AGTP01019 485 aa20.62■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 MARCKSL1P49006 195 aa20.62■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 NFE2L1Q14494 772 aa20.62■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 SARM1Q6SZW1 724 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 KCND3Q9UK17 655 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 PADI1Q9ULC6 663 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 C5orf60A6NFR6 353 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 GPR39O43194 453 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 F8A1P23610 371 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 AKT1P31749 480 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 PRPSAP1Q14558 356 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 PLCL1Q15111 1095 aa20.61■□□□□ 0.89
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