RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPRNQ16849 979 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 C16orf87Q6PH81 154 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CENPSQ8N2Z9 138 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC115Q96NT0 180 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPN18Q99952 460 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTL8Q9H568 366 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 COMMD8Q9NX08 183 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PADI3Q9ULW8 664 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ASB1Q9Y576 335 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNC4Q03721 635 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CHRNB3Q05901 458 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PWP1Q13610 501 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 FKBP9P1Q75LS8 142 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CLEC4FQ8N1N0 589 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CDYL2Q8N8U2 506 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4K2Q8NGD2 314 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.092e-10■■■■■ 52.7
HTATSF1-201ENST00000218364 PPM1MQ96MI6 270 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 IL37Q9NZH6 218 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 FUOMA2VDF0 154 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS26AO75436 327 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SULT1C4O75897 302 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 IGLV3-27P01718 113 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PKMP14618 531 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ERVPABLB-1P60509 514 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC23Q5W5X9 447 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 STK32CQ86UX6 486 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GPSM1Q86YR5 675 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 OR8J3Q8NGG0 315 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MGME1Q9BQP7 344 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GORASP2Q9H8Y8 452 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD28O15084 1053 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 TBX18O95935 607 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CD52P31358 61 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MTPNP58546 118 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 RELAQ04206 551 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CBX3Q13185 183 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SERINC5Q86VE9 423 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SPARTQ8N0X7 666 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC15A4Q8N697 577 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ESAMQ96AP7 390 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CSF3RQ99062 836 aa21.86■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6V1G1O75348 118 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CLPXO76031 633 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MTHFRP42898 656 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 EPS8Q12929 822 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF583Q96ND8 569 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 TOR3AQ9H497 397 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CORINQ9Y5Q5 1042 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GBF1Q92538 1859 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MYADML2A6NDP7 307 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMD7P51665 324 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PJA1Q8NG27 643 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 OR52B6Q8NGF0 335 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 UGT2B28Q9BY64 529 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM118AQ9NWS6 357 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CD274Q9NZQ7 290 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC3P53804 2025 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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HTATSF1-201ENST00000218364 GABARAPL2P60520 117 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 IL2P60568 153 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 LETMD1Q6P1Q0 360 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP20A1Q6UW02 462 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CD200R1Q8TD46 325 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 USE1Q9NZ43 259 aa21.84■■□□□ 1.09
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HTATSF1-201ENST00000218364 G3V2T6 193 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 OAZ2O95190 189 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 FUCA1P04066 466 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 G6PDP11413 515 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPK10P53779 464 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA0040Q15053 153 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CTSL3PQ5NE16 218 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.84■■□□□ 1.09
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