RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tp73Q9JJP2 631 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SufuQ9Z0P7 484 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ralgapa1Q6GYP7 2035 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ttc39aA2ACP1 578 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dusp2Q05922 318 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam91a1Q3UVG3 837 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chrnb3Q8BMN3 464 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klhl38Q8BSF5 581 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sfrp1Q8C4U3 314 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clptm1Q8VBZ3 664 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Anxa13Q99JG3 317 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MrgbpQ9DAT2 204 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lonp2Q9DBN5 852 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clcn2Q9R0A1 908 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Enpp2Q9R1E6 862 aa30■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Unc13cQ8K0T7 2210 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam181aJ3QNB7 292 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r169L7N275 304 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grk6O70293 576 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gmeb2P58929 530 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Foxd4Q60688 444 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pon2Q62086 354 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1344Q7TQV3 321 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mettl22Q8R1C6 393 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mrpl37Q921S7 423 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc97Q9DBT3 340 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sppl2aQ9JJF9 523 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Socs6Q9JLY0 533 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gipc2Q9Z2H7 314 aa29.99■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tbc1d16A2ABG4 766 aa29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnf39A2RT81 352 aa29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Galnt9G3X942 604 aa29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Top3aO70157 1003 aa29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eef1bO70251 225 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pip5k1bP70181 539 aa29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Marveld2Q3UZP0 555 aa29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mtfr1Q99MB2 328 aa29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trappc5Q9CQA1 188 aa29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 4933425L06RikQ9D3Z8 585 aa29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cacna1bO55017 2327 aa29.98■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tex16F6WNY1 1150 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 H2afxP27661 143 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Aldh3a1P47739 453 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tbx1P70323 479 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hif3aQ0VBL6 662 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Drd1Q61616 446 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gdpd5Q640M6 607 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrp10Q7TQH7 713 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrrtm4Q80XG9 590 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slco6c1Q8C0X7 706 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Galnt13Q8CF93 556 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcdhb21Q91V48 774 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc44a3Q921V7 656 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ankra2Q99PE2 312 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Otub2Q9CQX0 234 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prokr1Q9JKL1 393 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Msh5Q9QUM7 833 aa29.97■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grik2P39087 908 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam107aQ78TU8 144 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr606Q8VGZ8 319 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcdhga10Q91XY9 930 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcyt2Q922E4 404 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klc4Q9DBS5 619 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 RhojQ9ER71 214 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hey2Q9QUS4 339 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem245B1AZA5 876 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm20390E9PZF0 267 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dnajc21E9Q8D0 531 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Csf2rbP26955 896 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nme2Q01768 152 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TekQ02858 1122 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam149b1Q6NSV7 578 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trmt12Q8BG71 446 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Actl7aQ9QY84 440 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abhd1Q9QZC8 412 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Akap8lQ9R0L7 642 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ProdhQ9WU79 599 aa29.96■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tcf20Q9EPQ8 1987 aa29.95■■■□□ 2.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slfn3A0A1L1STQ7 640 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lonrf2B2RT44 518 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm16494E9Q2Z4 87 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn2r8L7N472 848 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 RelaQ04207 549 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CyrenQ8BHZ5 157 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TbcdQ8BYA0 1196 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1Q8VGI1 314 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr525Q8VGL5 309 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mta3Q924K8 591 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PllpQ9DCU2 182 aa29.95■■■□□ 2.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SelenonD3Z2R5 557 aa29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.2 ms