RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CES5A	Q6NT32	575 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CES3	Q6UWW8	571 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	OSTM1	Q86WC4	334 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC38A4	Q969I6	547 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	C19orf60	Q96EN9	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	HSFY1	Q96LI6	401 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RNF145	Q96MT1	663 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CPA4	Q9UI42	421 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A1W2PP18	115 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ENPP3	O14638	875 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LRIG2	O94898	1065 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	HRH2	P25021	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ALDH4A1	P30038	563 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	GLRB	P48167	497 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC9A3	P48764	834 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TNK1	Q13470	666 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC7A6	Q92536	515 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NCLN	Q969V3	563 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	GAD1	Q99259	594 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	EHD3	Q9NZN3	535 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PTGES3L	E9PB15	166 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ARHGEF9	O43307	516 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RGS20	O76081	388 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ANGPTL1	O95841	491 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CAPN1	P07384	714 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NAT2	P11245	290 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ARNT	P27540	789 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PSMB4	P28070	264 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PIGA	P37287	484 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC15A1	P46059	708 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	KIF19	Q2TAC6	998 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM80	Q96HE8	168 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CEP19	Q96LK0	163 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PSKH2	Q96QS6	385 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CITED4	Q96RK1	184 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NIPAL2	Q9H841	368 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	VPS4A	Q9UN37	437 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	AUP1	Q9Y679	476 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	OR2A25	A4D2G3	310 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	AOC2	O75106	756 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	EED	O75530	441 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CD36	P16671	472 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	STMN1	P16949	149 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PSMB9	P28065	219 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SDC4	P31431	198 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CAP1	Q01518	475 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	GPAT3	Q53EU6	434 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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