RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FMO1	Q01740	532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYTH2	Q99418	400 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525		E7ESA3	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525		K7ENM7	598 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BIRC5	O15392	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TYROBP	O43914	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NDUFB10	O96000	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRT16	P08779	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD63	P08962	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DES	P17661	470 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHRNB2	P17787	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLRC2	P26717	231 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TACR3	P29371	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFNAR2	P48551	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERPINB9	P50453	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYP2J2	P51589	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HSD17B4	P51659	736 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BCAT1	P54687	386 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNX16	P57768	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNJ2	P63252	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AP1B1	Q10567	949 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC6	Q16204	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KYNU	Q16719	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARC	Q7LC44	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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