RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CUL3Q13618 768 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 GALNT3Q14435 633 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CRY1Q16526 586 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM25Q86YD3 366 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM217AQ8IXS0 508 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXW8Q8N3Y1 598 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 POU5F2Q8N7G0 328 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 IL17RCQ8NAC3 791 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 NETO1Q8TDF5 533 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC9Q8WXX5 260 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD3Q9Y597 815 aa25.2■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 LPOP22079 712 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 PELI3Q8N2H9 469 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 KYQ8NBH2 561 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TSTD1Q8NFU3 115 aa25.19■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 DERL2Q9GZP9 239 aa25.19■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 HERVK_113P63132 956 aa25.18■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 GSTO2Q9H4Y5 243 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R13Q9NYV9 303 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF510Q9Y2H8 683 aa25.18■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC30A4O14863 429 aa25.18■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR13C4Q8NGS5 318 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNV2Q8TDN2 545 aa25.18■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 ANPEPP15144 967 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TIE1P35590 1138 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TTPAP49638 278 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 SCNN1BP51168 640 aa25.17■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 PGAM4Q8N0Y7 254 aa25.17■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 RGRP47804 291 aa25.16■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC16Q13042 620 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 ANO7Q6IWH7 933 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 MDGA1Q8NFP4 955 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 SGF29Q96ES7 293 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CLPTM1LQ96KA5 538 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 MUC3BQ9H195 1237 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 S100A14Q9HCY8 104 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 NMRK1Q9NWW6 199 aa25.16■■□□□ 1.62
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