RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	B4GALNT1	Q00973	533 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CAV1	Q03135	178 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	SEMA3A	Q14563	771 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	TRADD	Q15628	312 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC25	Q86WR0	208 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	NRROS	Q86YC3	692 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	APOLD1	Q96LR9	279 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TM4SF5	O14894	197 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	GIPC1	O14908	333 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TP73	O15350	636 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ITIH4	Q14624	930 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	CRYM	Q14894	314 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	LONRF1	Q17RB8	773 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM135	Q86UB9	458 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	NAT9	Q9BTE0	207 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		24.57	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	CBFA2T3	O75081	653 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	KCNK5	O95279	499 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ARNT	P27540	789 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	NSG1	P42857	185 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TTPA	P49638	278 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC3	Q13217	504 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	BIRC2	Q13490	618 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	KY	Q8NBH2	561 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ART4	Q93070	314 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC39	Q96DD0	335 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		24.56	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PFDN6	O15212	129 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFS3	O75489	264 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TTC4	O95801	387 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	CEACAM1	P13688	526 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	NR0B2	Q15466	257 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	AMZ2	Q86W34	360 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	KCNMB4	Q86W47	210 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ARL10	Q8N8L6	244 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	IFT81	Q8WYA0	676 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	SGSM3	Q96HU1	749 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		24.55	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TNFSF14	O43557	240 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	OR1I1	O60431	355 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	RPIA	P49247	311 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PROX2	Q3B8N5	592 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	BCL7A	Q4VC05	210 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PPM1J	Q5JR12	505 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TEX35	Q5T0J7	233 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	NEPRO	Q6NW34	567 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	CCNJL	Q8IV13	435 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		24.54	■■□□□ 1.52

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