RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RDH11	Q8TC12	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	STMN2	Q93045	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GINS2	Q9Y248	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	IPP	Q9Y573	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MGAM	O43451	1857 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0G2JND7	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF103	O00237	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC22A2	O15244	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FKBP6	O75344	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CIB2	O75838	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CABYR	O75952	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	USP1	O94782	785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	METTL18	O95568	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AP2A1	O95782	977 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GPANK1	O95872	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C1R	P00736	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINE1	P05121	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINA6	P08185	405 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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