RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	LHPP	Q9H008	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	EVC2	Q86UK5	1308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA3-210	ENST00000556321	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	STX6	O43752	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CD58	P19256	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	RAD23B	P54727	409 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CTSW	P56202	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TFF2	Q03403	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SCN1B	Q07699	218 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	STIM1	Q13586	685 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	EME1	Q96AY2	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	C5	P01031	1676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A087WV48	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A0G2JK05	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A0U1RQK1	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321		H0YAE9	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CREG1	O75629	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	KRT4	P19013	534 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GPT	P24298	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	HNF4A	P41235	474 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62	7e-6	■□□□□ 9.9
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CORO2A	Q92828	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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