RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TADA1	Q96BN2	335 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SPATA13	Q96N96	652 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	STK17B	O94768	372 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TUBB4A	P04350	444 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	GM2A	P17900	193 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	NFKB1	P19838	968 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CD86	P42081	329 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	GDF10	P55107	478 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TRAF2	Q12933	501 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SLC14A2	Q15849	920 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	C19orf60	Q96EN9	201 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	FCRL5	Q96RD9	977 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	POLQ	O75417	2590 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CDC14C	A4D256	554 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	FZD6	O60353	706 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	LDLR	P01130	860 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	POLD2	P49005	469 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CPZ	Q66K79	652 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	NAGS	Q8N159	534 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	GBA3	Q9H227	469 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PQ67	120 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	KATNA1	O75449	491 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PGLS	O95336	258 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PDHA1	P08559	390 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CA4	P22748	312 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	DLST	P36957	453 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	KCNJ1	P48048	391 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SUOX	P51687	545 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	NR1D2	Q14995	579 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	UGP2	Q16851	508 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	P3H1	Q32P28	736 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CROT	Q9UKG9	612 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PRSS38	A1L453	326 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222		B4E171	279 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TOR1B	O14657	336 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PHF2	O75151	1096 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	EML2	O95834	649 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	DLGAP3	O95886	979 aa		13.64	□□□□□ -0.23

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