RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 KCNJ13O60928 360 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 UBXN7O94888 489 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 NDUFA10O95299 355 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 AGTP01019 485 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 LIFP15018 202 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ITGB6P18564 788 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 IDSP22304 550 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 FECHP22830 423 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ATP5OP48047 213 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 GFERP55789 205 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 COPS2P61201 443 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 GTF2H3Q13889 308 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 PTPRCAPQ14761 206 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CLCA4Q14CN2 919 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 C9orf72Q96LT7 481 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 PANX2Q96RD6 677 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 POT1Q9NUX5 634 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 GPR39O43194 453 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TYRP1P17643 537 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 AMD1P17707 334 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CTSCP53634 463 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 GEMP55040 296 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 DMPKQ09013 629 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TTC25Q96NG3 672 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 GBA3Q9H227 469 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 J3QKU1 62 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 PPFIA2O75334 1257 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ANXA9O76027 345 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 FAM87AP0C7U9 286 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 VCLP18206 1134 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CTNNA2P26232 953 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 PTPN7P35236 360 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ADRA1AP35348 466 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ZNF75DP51815 510 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ITGA9Q13797 1035 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 GPR18Q14330 331 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 RANBP10Q6VN20 620 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 AMZ2Q86W34 360 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ACTL9Q8TC94 416 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ZNF398Q8TD17 642 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 RSC1A1Q92681 617 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TGM7Q96PF1 710 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 FICDQ9BVA6 458 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 PKP3Q9Y446 797 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ARL5AQ9Y689 179 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CS-229ENST00000551936 OR2AG2A6NM03 316 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-229ENST00000551936 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CS-229ENST00000551936 STK17BO94768 372 aa14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms