RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 CFAP99D6REC4 459 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ARNTP27540 789 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 DUPD1Q68J44 220 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 NAGSQ8N159 534 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 IFI44Q8TCB0 444 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 PRDM8Q9NQV8 689 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 EVA1BQ9NVM1 165 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22.18■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 SPTBN2O15020 2390 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 SMAPO00193 183 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 RFPL3O75679 317 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 MAZP56270 477 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.141e-6■■□□□ 11.5
BRF1-216ENST00000550208 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 BBS9Q3SYG4 887 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 BCL7AQ4VC05 210 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 PERM1Q5SV97 790 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 TMEM135Q86UB9 458 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 AMZ2Q86W34 360 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ARL14Q8N4G2 192 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 PRR19A6NJB7 356 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 OR1I1O60431 355 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ILKQ13418 452 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ITIH4Q14624 930 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 IYDQ6PHW0 289 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 DHRS13Q6UX07 377 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 CERS6Q6ZMG9 384 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 BBOF1Q8ND07 529 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 WHRNQ9P202 907 aa22.16■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ASXL3Q9C0F0 2248 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 KCNJ13O60928 360 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 SLC7A5Q01650 507 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 FOXC1Q12948 553 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 TRADDQ15628 312 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 PDIK1LQ8N165 341 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 MNS1Q8NEH6 495 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 TTC1Q99614 292 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 BPTFQ12830 3046 aa22.15■■□□□ 1.14
BRF1-216ENST00000550208 A6NCN8 305 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 MGAT4DA6NG13 374 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 USP1O94782 785 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ADRB1P08588 477 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 VCLP18206 1134 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PAMP19021 973 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 IDSP22304 550 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 NSG1P42857 185 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PRLHRP49683 370 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ARL4CP56559 192 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 NFE2L1Q14494 772 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 OR2L2Q8NH16 312 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CCDC74AQ96AQ1 378 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CCM2Q9BSQ5 444 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 RAB17Q9H0T7 212 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.14■■□□□ 1.13
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