RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 TPM3P06753 285 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 SHMT1P34896 483 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 EFNB1P98172 346 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 KRT72Q14CN4 511 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 TAF5Q15542 800 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 RUFY3Q7L099 469 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 CNTROBQ8N137 903 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 PLD5Q8N7P1 536 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 PIGTQ969N2 578 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 SCRN2Q96FV2 425 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ASCL2Q99929 193 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 NEURL2Q9BR09 285 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 CHMP4AQ9BY43 222 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 USP44Q9H0E7 712 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ADCY9O60503 1353 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 HEG1Q9ULI3 1381 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 STX6O43752 255 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 IGHV4-39P01824 125 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 GALTP07902 379 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 SYT1P21579 422 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 HOXC9P31274 260 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 EFNA5P52803 228 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 EFR3AQ14156 821 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 PPP2R5BQ15173 497 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 BEND3Q5T5X7 828 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ZNF599Q96NL3 588 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 REEP2Q9BRK0 252 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 OGFRQ9NZT2 677 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 MTMR6Q9Y217 621 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 UTYO14607 1347 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 AK9Q5TCS8 1911 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 TEX22C9J3V5 150 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 HIP1O00291 1037 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ZNHIT1O43257 154 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ADCY5O95622 1261 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 TFP02787 698 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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SGCE-211ENST00000522045 NOVP48745 357 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 AMPHP49418 695 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 SLC12A1Q13621 1099 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 UBE4AQ14139 1066 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 SYCP1Q15431 976 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 TTI2Q6NXR4 508 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 TMEM81Q6P7N7 255 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 FAM171BQ6P995 826 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 TDRPQ86YL5 185 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 STPG4Q8N801 248 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 IL17REQ8NFR9 667 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 DNAAF4Q8WXU2 420 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ELP4Q96EB1 424 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 LRR1Q96L50 414 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 QRFPRQ96P65 431 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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SGCE-211ENST00000522045 C20orf141Q9NUB4 165 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 HYPKQ9NX55 129 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 SMC3Q9UQE7 1217 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 ERVK-11Q9UQG0 969 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 PXDNQ92626 1479 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-211ENST00000522045 GLI3P10071 1580 aa4.53□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 TACC1O75410 805 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 IRF1P10914 325 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 KRT2P35908 639 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 ANO1Q5XXA6 986 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 LYG1Q8N1E2 194 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
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