RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 TNS4Q8IZW8 715 aa8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 PQLC3Q8N755 202 aa8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 GPR22Q99680 433 aa8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.76□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ARPC2O15144 300 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 SLC7A4O43246 635 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 SSX5O60225 188 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 MATN4O95460 622 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 CD1EP15812 388 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ALOX12P18054 663 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 HTR3AP46098 478 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 LIG4P49917 911 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 CLCNKBP51801 687 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 RAB14P61106 215 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 TAF5Q15542 800 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 UGP2Q16851 508 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 XKR9Q5GH70 373 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 DESI1Q6ICB0 168 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 UTS2BQ765I0 119 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 MCFD2Q8NI22 146 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 NME4O00746 187 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ANGPT2O15123 496 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 MFN2O95140 757 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 MED26O95402 600 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 LTFP02788 710 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 JUNDP17535 347 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 HTR1EP28566 365 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 TM4SF1P30408 202 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 MAN2A2P49641 1150 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 NAGLUP54802 743 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 OR2B6P58173 313 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 GRAPQ13588 217 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 NCF4Q15080 339 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF404Q494X3 552 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 PLD3Q8IV08 490 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 CLEC4FQ8N1N0 589 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 HMGCLL1Q8TB92 370 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 MFSD3Q96ES6 412 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 TASP1Q9H6P5 420 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 CISHQ9NSE2 258 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 SRRDQ9UH36 339 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 FBXO10Q9UK96 956 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 JAG2Q9Y219 1238 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 MED16Q9Y2X0 877 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 PSAT1Q9Y617 370 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 A8MU76 341 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 H0YIN7 160 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ARHGEF9O43307 516 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 RBBP9O75884 186 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 BPNT1O95861 308 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ALPLP05186 524 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 ELK4P28324 431 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 HLA-FP30511 346 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 SHMT2P34897 504 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 GNPDA1P46926 289 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 LTB4RQ15722 352 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 TAF12Q16514 161 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 STEAP3Q658P3 488 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 PMF1Q6P1K2 205 aa8.75□□□□□ -1.01
GPBP1-208ENST00000514387 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms