RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM159	Q96B96	161 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC38A3	Q99624	504 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CMKLR1	Q99788	373 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKP3	Q9Y446	797 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	LILRA5	A6NI73	299 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCL22	O00626	93 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIAS	O43766	372 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	JMJD7	P0C870	316 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPHA4	P54764	986 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	BIRC2	Q13490	618 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGA9	Q13797	1035 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TGIF1	Q15583	401 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	BMPER	Q8N8U9	685 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDAP1	Q8TB36	358 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP7	Q93009	1102 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	UCK1	Q9HA47	277 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATRX	P46100	2492 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2AG2	A6NM03	316 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2orf81	A6NN90	581 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZW10	O43264	779 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT86	O43790	486 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUX1	O43812	170 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP2A1	O95782	977 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS56	P0CW18	603 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC2A4	P14672	509 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPH1	P17752	444 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMA3	P25788	255 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAPK10	P53779	464 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXADR	P78310	365 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	DTX1	Q86Y01	620 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	JAML	Q86YT9	394 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR10G6	Q8NH81	332 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SGF29	Q96ES7	293 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASB8	Q9H765	288 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014		H7C0S8	307 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRTAM	O95727	393 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9	P02748	559 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ETS1	P14921	441 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GFER	P55789	205 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMPRSS15	P98073	1019 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF2H3	Q13889	308 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFE2L1	Q14494	772 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	P3H1	Q32P28	736 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	DET1	Q7L5Y6	550 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	AMZ2	Q86W34	360 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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