RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 RAD18Q9NS91 495 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SNX7Q9UNH6 387 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 KRT86O43790 486 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 VEGFDO43915 354 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CEACAM4O75871 244 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 GZMAP12544 262 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TCF4P15884 667 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CCNCP24863 283 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 HSD11B2P80365 405 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 NIPAL4Q0D2K0 466 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC6A19Q695T7 634 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 KMT5CQ86Y97 462 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TTC13Q8NBP0 860 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 GPR26Q8NDV2 337 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TEKT4Q8WW24 435 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MAML1Q92585 1016 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 C19orf60Q96EN9 201 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TRIM11Q96F44 468 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 KCND1Q9NSA2 647 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 GPR83Q9NYM4 423 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 DTLQ9NZJ0 730 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MTX2O75431 263 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 JCHAINP01591 159 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MYBL1P10243 752 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 FECHP22830 423 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 RRADP55042 308 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 PPP1CAP62136 330 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TUBB4BP68371 445 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 GALNT2Q10471 571 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MMRN1Q13201 1228 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TUBB2AQ13885 445 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 PLCL1Q15111 1095 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MED25Q71SY5 747 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 IQCKQ8N0W5 287 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TTC25Q96NG3 672 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MAP3K3Q99759 626 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SYT11Q9BT88 431 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TUBB2BQ9BVA1 445 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 NUDT9Q9BW91 350 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CHST8Q9H2A9 424 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 HAUS4Q9H6D7 363 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ANKUB1A6NFN9 424 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CBX6O95503 412 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC4A1P02730 911 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CD86P42081 329 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 GSDMDP57764 484 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 GTF2H3Q13889 308 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ASIC2Q16515 512 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ARMC6Q6NXE6 501 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CCNYQ8ND76 341 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 OR8K5Q8NH50 307 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 GDAP1Q8TB36 358 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 EID2BQ96D98 161 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TSGA13Q96PP4 275 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CD180Q99467 661 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 NUP85Q9BW27 656 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MYO6Q9UM54 1294 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 LRRC10BA6NIK2 292 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MEN1O00255 615 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MFSD11O43934 449 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 KCNJ13O60928 360 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 HLA-DQB2P05538 268 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 VAV2P52735 878 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 DCDC1P59894 354 aa15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms