RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTC9Q92623 222 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ART4Q93070 314 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POT1Q9NUX5 634 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MGAQ8IWI9 3026 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EFCAB7A8K855 629 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNN4O15554 427 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UGT1A9O60656 530 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UGT1A6P19224 532 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UGT1A1P22309 533 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UGT1A4P22310 534 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADRA1AP35348 466 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UGT1A3P35503 534 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC19A1P41440 591 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAPK9P45984 424 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP1A2P50993 1020 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XKR5Q6UX68 686 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AMZ2Q86W34 360 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM129CQ86XR2 697 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF398Q8TD17 642 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SGF29Q96ES7 293 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATA13Q96N96 652 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZPBPQ9BS86 351 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FICDQ9BVA6 458 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMOXQ9NWM0 555 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLHL33A6NCF5 533 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A8MU76 341 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRTAMO95727 393 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC25BP30305 580 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HALP42357 657 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MC2RQ01718 297 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DMPKQ09013 629 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM139Q8IV31 216 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BMPERQ8N8U9 685 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBXN7O94888 489 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C9P02748 559 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRB1P04280 392 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITGB2P05107 769 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BRAFP15056 766 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AMD1P17707 334 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MSH3P20585 1137 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMB4P28070 264 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PARP6Q2NL67 630 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NKD1Q969G9 470 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARL5AQ9Y689 179 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C1QL1O75973 258 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRAMEF1O95521 474 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AKT1P31749 480 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HADHAP40939 763 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms