RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 NLKQ9UBE8 527 aa2.25□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 VPS4AQ9UN37 437 aa2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa2.25□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SBF2Q86WG5 1849 aa2.25□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 H0YIZ8 118 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 ACO1P21399 889 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 MTHFRP42898 656 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 PPA1Q15181 289 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 FBXO43Q4G163 708 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ADIPOR2Q86V24 386 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SYCP3Q8IZU3 236 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF276Q8N554 614 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF347Q96SE7 839 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 WNT5BQ9H1J7 359 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM206Q9H813 350 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 MAGEE1Q9HCI5 957 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PARPBPQ9NWS1 579 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CYP39A1Q9NYL5 469 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 RAI14Q9P0K7 980 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TRPC4Q9UBN4 977 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM10Q9UDY6 481 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF10O15013 1369 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 CLIC2O15247 247 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 CBX6O95503 412 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TTLL1O95922 423 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 IGHDP01880 384 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC25A3Q00325 362 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TERB1Q8NA31 727 aa2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 NHLRC2Q8NBF2 726 aa2.24□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 HES6Q96HZ4 224 aa2.24□□□□□ -2.05
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