RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 LCP2Q13094 533 aa10.66□□□□□ -0.7
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SH3BP2-209ENST00000504450 SQLEQ14534 574 aa10.66□□□□□ -0.7
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SH3BP2-209ENST00000504450 CIB2O75838 187 aa10.65□□□□□ -0.7
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SH3BP2-209ENST00000504450 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.76e-7■■■■□ 20.2
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R3AQ16821 1122 aa10.65□□□□□ -0.7
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SH3BP2-209ENST00000504450 AIM2O14862 343 aa10.64□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 ESRRBO95718 433 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 MLYCDO95822 493 aa10.64□□□□□ -0.71
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