RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 NCF4Q15080 339 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 OOSP2Q86WS3 158 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NCSTNQ92542 709 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ULK4Q96C45 1275 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SGSM3Q96HU1 749 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ING2Q9H160 280 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 APMAPQ9HDC9 416 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ABI3Q9P2A4 366 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 EML2O95834 649 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CYP1A2P05177 515 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SCNN1BP51168 640 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CACNG1Q06432 222 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NINJ1Q92982 152 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 FITM1A5D6W6 292 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 K7EM74 188 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CD1EP15812 388 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 LAMA1P25391 3075 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PSMA2P25787 234 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 MIPP30301 263 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 IL10RAQ13651 578 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SYCP1Q15431 976 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TAZQ16635 292 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC38Q5VT99 294 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 MCEEQ96PE7 176 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SOX11P35716 441 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 UQCRFS1P47985 274 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 POLD2P49005 469 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF165P49910 485 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NADK2Q4G0N4 442 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RAB6CQ53S08 254 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 OR2L2Q8NH16 312 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 VAT1Q99536 393 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RDH14Q9HBH5 336 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 FANCLQ9NW38 375 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TTLL8A6PVC2 850 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 MASP2O00187 686 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 QSOX1O00391 747 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CREB3O43889 395 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 KDM1AO60341 852 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 BRAFP15056 766 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 AGXTP21549 392 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TDGF1P3P51864 188 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ITGA9Q13797 1035 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 GTF2H3Q13889 308 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 RPE65Q16518 533 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 C16orf46Q6P387 395 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 XKRXQ6PP77 449 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 KCNMB4Q86W47 210 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 LGI4Q8N135 537 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 NEK11Q8NG66 645 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 ABCB7O75027 752 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 KRT38O76015 456 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 AP2A2O94973 939 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 MYBL2P10244 700 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-210ENST00000503258 CASP14P31944 242 aa7.53□□□□□ -1.2
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