RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC7A1P30825 629 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GRK6P43250 576 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP3CCP48454 512 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2HP62256 183 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC3A1Q07837 685 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STX5Q13190 355 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CHRNA6Q15825 494 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SSX2Q16385 188 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LIPNQ5VXI9 398 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HTR3DQ70Z44 454 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ATCAYQ86WG3 371 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR8J2Q8NGG1 315 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM111AQ96PZ2 611 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 IL25Q9H293 177 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NPHS2Q9NP85 383 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 UFSP2Q9NUQ7 469 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 F8VP50 259 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ACKR2O00590 384 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DVL2O14641 736 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GABRDO14764 452 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CCL16O15467 120 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NOBOXO60393 691 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR52Z1P0C646 297 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP2A7P20853 494 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GJC1P36383 396 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 VHLP40337 213 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GNG11P61952 73 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TYRO3Q06418 890 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NR1H3Q13133 447 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 UGCGQ16739 394 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DUSP7Q16829 419 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A25Q6T423 547 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PADI6Q6TGC4 694 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CAMKMTQ7Z624 323 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC7A14Q8TBB6 771 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LIPHQ8WWY8 451 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX19Q92543 992 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CPB2Q96IY4 423 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BBS4Q96RK4 519 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MMP27Q9H306 513 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OSGEPQ9NPF4 335 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 IMPACTQ9P2X3 320 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LRWD1Q9UFC0 647 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AURKCQ9UQB9 309 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NID2Q14112 1375 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 XKRY2A2RUG3 117 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TGM5O43548 720 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GMDSO60547 372 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PFKFB2O60825 505 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NOL3O60936 208 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ECI2O75521 394 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ESRRBO95718 433 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BMP15O95972 392 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CSTAP01040 98 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MBP02144 154 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CD44P16070 742 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GLRA2P23416 452 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1D2P34982 312 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PIK3CBP42338 1070 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PTGIRP43119 386 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SELENBP1Q13228 472 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM189A2Q15884 450 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PAGE2BQ5JRK9 111 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf120Q5SQS8 335 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC9A4Q6AI14 798 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 JADE1Q6IE81 842 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms