RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1W2PPC4 97 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 H0Y8X5 98 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 DNAJC6O75061 913 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 FTH1P02794 183 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 SLC35E2BP0CK96 405 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 NR1D1P20393 614 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 SH2D5Q6ZV89 423 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 BANPQ8N9N5 519 aa21.74■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 BMFQ96LC9 184 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.74■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 GALPQ9UBC7 116 aa21.74■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 MED16Q9Y2X0 877 aa21.74■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 MUC3AQ02505 3323 aa21.74■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 C10orf142B7Z368 130 aa21.73■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 CCNFP41002 786 aa21.73■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 CTSCP53634 463 aa21.73■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 PPP2R2AP63151 447 aa21.73■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 IRF9Q00978 393 aa21.73■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.73■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 SYTL2Q9HCH5 934 aa21.73■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 FAM53CQ9NYF3 392 aa21.73■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.73■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.73■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 CD9P21926 228 aa21.72■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 GCNT7Q6ZNI0 430 aa21.72■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.72■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 CD200R1Q8TD46 325 aa21.72■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 GLRA3O75311 464 aa21.71■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 KELP23276 732 aa21.71■■□□□ 1.07
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PSPC1-204ENST00000492741 ELMO1Q92556 727 aa21.71■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 CCM2Q9BSQ5 444 aa21.71■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.71■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.71■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 GPR34Q9UPC5 381 aa21.71■■□□□ 1.07
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM202A6NGA9 273 aa21.7■■□□□ 1.06
PSPC1-204ENST00000492741 KPNA5O15131 536 aa21.7■■□□□ 1.06
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