RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C19orf60Q96EN9 201 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC7A4O43246 635 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRP2O60462 931 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSTT2P0CG29 244 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSTT2BP0CG30 244 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYBPC1Q00872 1141 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SQLEQ14534 574 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUT11Q495W5 492 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDT8Q8WV74 236 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CROTQ9UKG9 612 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MED16Q9Y2X0 877 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HLA-DPA1P20036 260 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLIN5Q00G26 463 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NADK2Q4G0N4 442 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFP1Q6P2D0 407 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYHR1Q6ZMK1 362 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPAN33Q86UF1 283 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BBS5Q8N3I7 341 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TADA1Q96BN2 335 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTBD9Q96Q07 612 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC29A1Q99808 456 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPAG4Q9NPE6 437 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GREM1O60565 184 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFS3O75489 264 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MT-ND1P03886 318 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMIM18P0DKX4 95 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CR2P20023 1033 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJB13P59910 316 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRP8Q14114 963 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDZD8Q8NEN9 1154 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK15Q96Q40 435 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAAP1Q9H8G2 361 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEAF6Q9HAF1 191 aa15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KNL1Q8NG31 2342 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0J9YYE9 177 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ILVBLA1L0T0 632 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C7orf72A4D263 438 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IMPDH1P20839 514 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJB1P25685 340 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STC1P52823 247 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XIAPP98170 497 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB33AQ14088 237 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HERC3Q15034 1050 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RETREG3Q86VR2 466 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPNE9Q8IYJ1 553 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CANT1Q8WVQ1 401 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLD4Q96BZ4 506 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASB9Q96DX5 294 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARPC5LQ9BPX5 153 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTTG2Q9NZH5 202 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LHX3Q9UBR4 397 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANTXRLA6NF34 631 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK14O94921 469 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF15O94989 841 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN7O95471 211 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRG1P02750 347 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HK2P52789 917 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMARCB1Q12824 385 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LMAN2Q12907 356 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRNIPQ6NTE8 343 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS33AQ96AX1 596 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC126Q96EE4 140 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCF25Q9BQ70 676 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCB8Q9NUT2 735 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFAP2AP05549 437 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD1DP15813 335 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRS1P35568 1242 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms