RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 NFS1Q9Y697 457 aa11.57□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SCN8AQ9UQD0 1980 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 PATE3B3GLJ2 98 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 TAF4O00268 1085 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 MAP2K7O14733 419 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 RAD51BO15315 384 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 PLXNA2O75051 1894 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 GNSP15586 552 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 POU4F1Q01851 419 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 CTBP1Q13363 440 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 UGT3A1Q6NUS8 523 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 MACC1Q6ZN28 852 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 KLK6Q92876 244 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 VPS39Q96JC1 886 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 BMFQ96LC9 184 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 HSPA12BQ96MM6 686 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 PANX3Q96QZ0 392 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 ORAI3Q9BRQ5 295 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 P2RY12Q9H244 342 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 POPDC3Q9HBV1 291 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 LATS2Q9NRM7 1088 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 LGALS13Q9UHV8 139 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 AKAP13Q12802 2813 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 MYLKQ15746 1914 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 CHUKO15111 745 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 OPA1O60313 960 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 FAM155BO75949 473 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 CDK14O94921 469 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 HAUS5O94927 633 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 FTH1P02794 183 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SHBGP04278 402 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 PKMP14618 531 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 BCKDHBP21953 392 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 CD38P28907 300 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 AKT1P31749 480 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 THOP1P52888 689 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SEMA3AQ14563 771 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 NFATC4Q14934 902 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 TEAD4Q15561 434 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 BCL7AQ4VC05 210 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 GCNT7Q6ZNI0 430 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 TIFABQ6ZNK6 161 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 FRMD1Q8N878 549 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 DEFB124Q8NES8 71 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SNX19Q92543 992 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 KCNJ9Q92806 393 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 PGM2Q96G03 612 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 CABS1Q96KC9 395 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 WDR92Q96MX6 357 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 ZIM3Q96PE6 472 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 GPR22Q99680 433 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 FAM96AQ9H5X1 160 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 EBF2Q9HAK2 575 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 GPR27Q9NS67 375 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SENP1Q9P0U3 644 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 DSPP15924 2871 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 LAMA5O15230 3695 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GTW7 788 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
NISCH-211ENST00000488243 POM121BA6NF01 834 aa11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms