RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 SGF29Q96ES7 293 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 FOXP3Q9BZS1 431 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 CPNE7Q9UBL6 633 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 SNX12Q9UMY4 172 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 SATB2Q9UPW6 733 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 CHD8Q9HCK8 2581 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 A6NCN8 305 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 MROH6A6NGR9 719 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 USP27XA6NNY8 438 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 AGAP14A8MT82 685 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 TAF4O00268 1085 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 CES2O00748 559 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 BRINP1O60477 761 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 VIPP01282 170 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT14P02533 472 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 RPL10P27635 214 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 HALP42357 657 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 GNG11P61952 73 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 GPLD1P80108 840 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 CACNG1Q06432 222 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 NLRP9Q7RTR0 991 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 C11orf96Q7Z7L8 435 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 OR10G6Q8NH81 332 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 RANBP9Q96S59 729 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 DPYSL5Q9BPU6 564 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 RDH14Q9HBH5 336 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 KLHL33A6NCF5 533 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TCP1P17987 556 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 CD1CP29017 333 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 CCKBRP32239 447 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 COILP38432 576 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 VPS41P49754 854 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 SARNPP82979 210 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 PHF19Q5T6S3 580 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 NKAIN2Q5VXU1 208 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 WASH2PQ6VEQ5 465 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 SERPINA9Q86WD7 417 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXO39Q8N4B4 442 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 CXorf40BQ96DE9 158 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC1Q99614 292 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 WASH6PQ9NQA3 447 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 BFARQ9NZS9 450 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 PYCARDQ9ULZ3 195 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 AKAP13Q12802 2813 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 CEP295Q9C0D2 2601 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 MGAT4DA6NG13 374 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 ACRV1P26436 265 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 NPY2RP49146 381 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 PDX1P52945 283 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TERF1P54274 439 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 DRG2P55039 364 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 CDK16Q00536 496 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 DMPKQ09013 629 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 GPS1Q13098 491 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP1B1Q16678 543 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 BCL7AQ4VC05 210 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 PCID2Q5JVF3 399 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 AGAP9Q5VTM2 703 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC27Q6P3X3 843 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB11FIP2Q7L804 512 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 FGF11Q92914 225 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 HDAC10Q969S8 669 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 RIMKLBQ9ULI2 386 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 RAXQ9Y2V3 346 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TCAF1Q9Y4C2 921 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 URB1O60287 2271 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF185O15231 689 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 DUX1O43812 170 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TPSB2P20231 275 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms