RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 OR52A4PA6NMU1 304 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CHUKO15111 745 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MTX2O75431 263 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RASSF9O75901 435 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RECKO95980 971 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 AVPP01185 164 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 JCHAINP01591 159 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PIRTP0C851 137 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SLC2A4P14672 509 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CES1P23141 567 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CCNCP24863 283 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PRKCIP41743 596 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF165P49910 485 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CCL11P51671 97 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MYL5Q02045 173 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 GALNT2Q10471 571 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 LAMB3Q13751 1172 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ALS2CLQ60I27 953 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CPZQ66K79 652 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 LCN10Q6JVE6 187 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF547Q8IVP9 402 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CNTD1Q8N815 330 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TEKT4Q8WW24 435 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TSGA13Q96PP4 275 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MLXIPLQ9NP71 852 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 KCND3Q9UK17 655 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MYO6Q9UM54 1294 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 FLNCQ14315 2725 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RGSL1A5PLK6 1076 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ARGFXA6NJG6 315 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CA5AP35218 305 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SERPINB6P35237 376 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CD86P42081 329 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 GBE1Q04446 702 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 DPYSL3Q14195 570 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 GPR18Q14330 331 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 GALNT3Q14435 633 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 KRT81Q14533 505 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 INSCQ1MX18 579 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF787Q6DD87 383 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 IRGCQ6NXR0 463 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PQLC3Q8N755 202 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TRIB3Q96RU7 358 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 THAP2Q9H0W7 228 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ACTL8Q9H568 366 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 LUZP4Q9P127 313 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 EPHA6Q9UF33 1036 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SCINQ9Y6U3 715 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms