RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 HSF1Q00613 529 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MVPQ14764 893 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6YL49 198 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CHSY1Q86X52 802 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 C4orf19Q8IY42 314 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RASGEF1CQ8N431 466 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB44Q8NCP5 570 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D16Q8TBP0 767 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CAGE1Q8TC20 777 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 NSMAFQ92636 917 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ERLEC1Q96DZ1 483 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TOX2Q96NM4 488 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 WNT5BQ9H1J7 359 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FN3KQ9H479 309 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MINDY3Q9H8M7 445 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 COMMD8Q9NX08 183 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 STK26Q9P289 416 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ACSL5Q9ULC5 683 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RGSL1A5PLK6 1076 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SELENOFO60613 162 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC16A8O95907 504 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 EGFP01133 1207 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB40ALP0C0E4 278 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 G6PDP11413 515 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TCF4P15884 667 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.465e-6■■■■□ 20.5
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CTSWP56202 376 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CDK3Q00526 305 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL30Q0D2K2 578 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXI1Q12951 378 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MELKQ14680 651 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 NR1D2Q14995 579 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PDK1Q15118 436 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF124Q15973 351 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CASC4Q6P4E1 433 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM71Q6P5X7 295 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 NEK11Q8NG66 645 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC13A3Q8WWT9 602 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 APBB2Q92870 758 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP4K1Q92918 833 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SLAMF9Q96A28 289 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 HSD3B7Q9H2F3 369 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D17Q9HA65 648 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 LMAN1LQ9HAT1 526 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MCM9Q9NXL9 1143 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R3Q9NYW6 316 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKUB1A6NFN9 424 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 KIR2DS3K7RE56 304 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC16A5O15375 505 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SSX4O60224 188 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPAN1O60635 241 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MED24O75448 989 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PGLSO95336 258 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 GH1P01241 217 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ALPPP05187 535 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ALPPL2P10696 532 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNA2P20248 432 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 IL15P40933 162 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FRKP42685 505 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RABIFP47224 123 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ME1P48163 572 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD23BP54727 409 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CDH12P55289 794 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 UBASH3AP57075 661 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC39A14Q15043 492 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SGCBQ16585 318 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 AARDQ4LEZ3 155 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF6Q58WW2 860 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC27A1Q6PCB7 646 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM57BQ71RH2 274 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms