RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 C21orf59P57076 290 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 VSNL1P62760 191 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NHLH1Q02575 133 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CACNG1Q06432 222 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NFATC2Q13469 925 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ITGA9Q13797 1035 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CRYMQ14894 314 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NFATC4Q14934 902 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OCLNQ16625 522 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 LONRF1Q17RB8 773 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 KIF19Q2TAC6 998 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ARMC3Q5W041 872 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 STEAP4Q687X5 459 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 KCTD16Q68DU8 428 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SNX20Q7Z614 316 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CCNJLQ8IV13 435 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PALM2Q8IXS6 379 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4L1Q8NH43 312 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GDAP1Q8TB36 358 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 DTX3LQ8TDB6 740 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NAT14Q8WUY8 206 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PEX13Q92968 403 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GLYATL1Q969I3 302 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 COX14Q96I36 57 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FMO2Q99518 471 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM202A6NGA9 273 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TOR1BO14657 336 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GNB5O14775 395 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CEACAM5P06731 702 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ERVK-10P10266 1014 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 EPB42P16452 691 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TNFRSF8P28908 595 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SSTR1P30872 391 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 DPP6P42658 865 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 IDH3AP50213 366 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NXPH1P58417 271 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA1024LP59773 190 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GPX6P59796 221 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 YPEL5P62699 121 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 IRX4P78413 519 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FZD2Q14332 565 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 KYNUQ16719 465 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GPRC6AQ5T6X5 926 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NEPROQ6NW34 567 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 IQCHQ86VS3 1027 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNMB4Q86W47 210 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NXPE1Q8N323 547 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 DCLK2Q8N568 766 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CEP76Q8TAP6 659 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TCEAL3Q969E4 200 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms