RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 VAMP7P51809 220 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CASP5P51878 434 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 LIMK2P53671 638 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 IST1P53990 364 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 WNT3AP56704 352 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP3K7CLP57077 242 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS21P63220 83 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 NUCB1Q02818 461 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CDH18Q13634 790 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF235Q14590 738 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 POSTNQ15063 836 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 LONRF1Q17RB8 773 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 GRAMD1BQ3KR37 738 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ADCK5Q3MIX3 580 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 AMZ1Q400G9 498 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TPRG1LQ5T0D9 272 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ARTNQ5T4W7 220 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MTFR2Q6P444 385 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 DAAM2Q86T65 1068 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SRLQ86TD4 932 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 DRC7Q8IY82 874 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM186BQ8IYM0 893 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FIBINQ8TAL6 211 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 POMGNT1Q8WZA1 660 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 APIPQ96GX9 242 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 C18orf12Q96KH6 178 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TNIP3Q96KP6 325 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC17A9Q9BYT1 436 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ING2Q9H160 280 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 GCM1Q9NP62 436 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 DYRK4Q9NR20 520 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KCND2Q9NZV8 630 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SARDHQ9UL12 918 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 NME7Q9Y5B8 376 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PCM1Q15154 2024 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 NUP210LQ5VU65 1888 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ARGFXA6NJG6 315 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PP2D1A8MPX8 630 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TISP43B9A030 160 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MYO1FO00160 1098 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 BIN1O00499 593 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MCF2LO15068 1137 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RAD51BO15315 384 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 IRAK2O43187 625 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 AKR1B10O60218 316 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CEACAM4O75871 244 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP7B1O75881 506 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 BEST1O76090 585 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF20AO95235 890 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 LATS1O95835 1130 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TNNC2P02585 160 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SETSIPP0DME0 302 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 THRAP10827 490 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF28P17035 718 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TYRP1P17643 537 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PCSK6P29122 969 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ALDH4A1P30038 563 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ECHS1P30084 290 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PIK3CBP42338 1070 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PFN3P60673 137 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 YPEL5P62699 121 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TNNC1P63316 161 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 B4GALNT1Q00973 533 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MC2RQ01718 297 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FOLH1Q04609 750 aa4.03□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CHAF1BQ13112 559 aa4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms