RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 THSD1Q9NS62 852 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CPNE7Q9UBL6 633 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 PRR19A6NJB7 356 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 OR52A4PA6NMU1 304 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CEP104O60308 925 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 PPFIA2O75334 1257 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 POP7O75817 140 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 JMJD7P0C870 316 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CCL4P13236 92 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 MSH3P20585 1137 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC19A1P41440 591 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 GRIA1P42261 906 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 MAPK10P53779 464 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 ERVPABLB-1P60509 514 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 P3H1Q32P28 736 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC38Q502W7 563 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 SPACA3Q8IXA5 215 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 DTX3LQ8TDB6 740 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 WDR70Q9NW82 654 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 PSMD13Q9UNM6 376 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 WDR37Q9Y2I8 494 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A0G2JNG1 304 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 A8MU76 341 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CDRT15L2A8MXV6 281 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 KIR2DS3K7RE56 304 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 FGGP02679 453 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 KIR2DS5Q14953 304 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 PDZD3Q86UT5 571 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF248Q8NDW4 579 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM58Q8NG06 486 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 SMOXQ9NWM0 555 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 NRDCO43847 1150 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 IDSP22304 550 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC5A2P31639 672 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 STIP1P31948 543 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 MC4RP32245 332 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNJ1P48048 391 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 NFE2L1Q14494 772 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CLCA4Q14CN2 919 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 IGF2-ASQ6U949 168 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM48Q8IWZ4 208 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 NCSTNQ92542 709 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC45Q96CN5 670 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHL3Q9UH77 587 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 ZW10O43264 779 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 VIPP01282 170 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 ITGA2BP08514 1039 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC2A4P14672 509 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 LMAN1P49257 510 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 LIMK2P53671 638 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 AMZ2Q86W34 360 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 OR10G6Q8NH81 332 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNE4Q8WWG9 221 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 USP7Q93009 1102 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 PMEPA1Q969W9 287 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 RAB6BQ9NRW1 208 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM208BQ5VWN6 2430 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 OR51F1A6NGY5 319 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 OR5K4A6NMS3 321 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 KLK10O43240 276 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 PSMD3O43242 534 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 SGTAO43765 313 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 PRAMEF10O60809 474 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 TYRP1P17643 537 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 RPL22P35268 128 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 ARSDP51689 593 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 TERF1P54274 439 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 TLE3Q04726 772 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CCNG2Q16589 344 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CLEC14AQ86T13 490 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC89Q8N998 374 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAAF3Q8N9W5 541 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 OR4D9Q8NGE8 314 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXJ2Q9P0K8 574 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 E7EVH7 732 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 DUX1O43812 170 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms