RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458938.2

U3.44-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 192 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.44-201ENST00000458938 AMACRQ9UHK6 382 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 LCMT1Q9UIC8 334 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 FBXL21Q9UKT6 434 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 GUCA1BQ9UMX6 200 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 SIT1Q9Y3P8 196 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 ATP23Q9Y6H3 246 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 COL4A3Q01955 1670 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 VCANP13611 3396 aa3.61□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 DENND4CQ5VZ89 1909 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 A0A1B0GVM2 712 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 A0A1W2PP55 124 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 A0A1W2PQF6 199 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 MAGEB16A2A368 324 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 FAM86C2PA6NEL3 165 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 TCAF2A6NFQ2 919 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 TTC34A8MYJ7 566 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 UPK3BL1B0FP48 263 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 ZNF487B1APH4 448 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 UPK3BL2E5RIL1 263 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 E9PI62 339 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 J3KR12 359 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 K7ERQ8 282 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 UBE2CO00762 179 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 TSPAN4O14817 238 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 NPC1O15118 1278 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 KPNA5O15131 536 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 VILLO15195 856 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 FANCGO15287 622 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 KDELR3O43731 214 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 KRT86O43790 486 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 SNAP91O60641 907 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 SMPD2O60906 423 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 FTCDO95954 541 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 PEX11BO96011 259 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 NPPAP01160 153 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 KRT14P02533 472 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 CYBBP04839 570 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 APODP05090 189 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 GSNP06396 782 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 FESP07332 822 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 IVLP07476 585 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 DCNP07585 359 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 ITGA2BP08514 1039 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 KRT7P08729 469 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 MYZAPP0CAP1 466 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 GAAP10253 952 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 CKMT1AP12532 417 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 TDGF1P13385 188 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 NME1P15531 152 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 CDH3P22223 829 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 GALP22466 123 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 GLDCP23378 1020 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 HTR1BP28222 390 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 OR1E1P30953 314 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 HTR7P34969 479 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 BMI1P35226 326 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 TRIM23P36406 574 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 CSKP41240 450 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 CASP3P42574 277 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 MAGEA4P43358 317 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 FNTAP49354 379 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 NUMBP49757 651 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 ARFIP1P53367 373 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 CDH6P55285 790 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 SSTP61278 116 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 PHC1P78364 1004 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 PRAMEP78395 509 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 GNA12Q03113 381 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 GBE1Q04446 702 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 KDSRQ06136 332 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 MAP4K2Q12851 820 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 MTAPQ13126 283 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 CUL1Q13616 776 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 SLC12A1Q13621 1099 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 COTL1Q14019 142 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 DMC1Q14565 340 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 ZNF460Q14592 562 aa3.6□□□□□ -1.83
U3.44-201ENST00000458938 IHHQ14623 411 aa3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms