RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 C5AR2Q9P296 337 aa5.07□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 COPG2Q9UBF2 871 aa5.07□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.07□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.07□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RARRES3Q9UL19 164 aa5.07□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.07□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.07□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa5.07□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 MED13LQ71F56 2210 aa5.07□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SHANK1Q9Y566 2161 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 F5H423 210 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FAM72CH0Y354 149 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PDPK1O15530 556 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 DAPK3O43293 454 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TMEM63AO94886 807 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 IGHEP01854 428 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FGF5P12034 268 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 IMPDH2P12268 514 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PRF1P14222 555 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CYP11B1P15538 503 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TYRP1P17643 537 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TEAD1P28347 426 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 VIPR1P32241 457 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FLT3P36888 993 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ETV3P41162 512 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 AP1S1P61966 158 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 DPTQ07507 201 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RALGDSQ12967 914 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PAK1Q13153 545 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FXNQ16595 210 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 EXOC3L4Q17RC7 722 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PTPN20Q4JDL3 420 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PYCR3Q53H96 274 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 VWA2Q5GFL6 755 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SLC6A19Q695T7 634 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 KLHL10Q6JEL2 608 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 KLHL35Q6PF15 583 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 TRIM65Q6PJ69 517 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 STRADAQ7RTN6 431 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FAM72BQ86X60 149 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 XYLT1Q86Y38 959 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 BBS5Q8N3I7 341 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FDCSPQ8NFU4 85 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ELOA3Q8NG57 546 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 EXD1Q8NHP7 514 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 AP2M1Q96CW1 435 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 COQ10AQ96MF6 247 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CRACR2AQ9BSW2 395 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 RMI1Q9H9A7 625 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 WASH6PQ9NQA3 447 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FANCLQ9NW38 375 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 LHX3Q9UBR4 397 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 B4GALT6Q9UBX8 382 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 SNX7Q9UNH6 387 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 OSGIN2Q9Y236 505 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 APCP25054 2843 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ZFHX3Q15911 3703 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PCNX1Q96RV3 2341 aa5.06□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 ESYT3A0FGR9 886 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 BECN2A8MW95 431 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 WASH4PA8MWX3 477 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 H3BRJ5 948 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 J3KR12 359 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PSMD11O00231 422 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PEX12O00623 359 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 PRAMEF11O60813 436 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CEACAM4O75871 244 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 HTR3BO95264 441 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 LSM8O95777 96 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 C9P02748 559 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 CTSBP07858 339 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 KRT3P12035 628 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1-204ENST00000444685 F3P13726 295 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms