RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PPP2R1BP30154 601 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC7A1P30825 629 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC1A2P43004 574 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 KCNC1P48547 511 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SEC13P55735 322 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PSMC5P62195 406 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 HACD4Q5VWC8 232 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 USP45Q70EL2 814 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PAQR7Q86WK9 346 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM139Q8IV31 216 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 NRG4Q8WWG1 115 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MUL1Q969V5 352 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC41A3Q96GZ6 507 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ANAPC7Q9UJX3 599 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PDE10AQ9Y233 779 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PIK3C2GO75747 1445 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 BHLHE40O14503 412 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 HS6ST1O60243 411 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SULT1C4O75897 302 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MPOP05164 745 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PET100P0DJ07 73 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 COL6A1P12109 1028 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 COILP38432 576 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TLE4Q04727 773 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ORC1Q13415 861 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TDGQ13569 410 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CYP51A1Q16850 503 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL22Q53GT1 634 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PM20D1Q6GTS8 502 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 DPP9Q86TI2 863 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 HID1Q8IV36 788 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 OFCC1Q8IZS5 231 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 GJA10Q969M2 543 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RAB3CQ96E17 227 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MARK4Q96L34 752 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CCM2Q9BSQ5 444 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MENTQ9BUN1 341 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF521Q96K83 1311 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 C20orf202A1L168 122 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FABP12A6NFH5 140 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 M0QYV0 167 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC31A2O15432 143 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PROM1O43490 865 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ATG13O75143 517 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 GH1P01241 217 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PIGRP01833 764 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 STSP08842 583 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 GRIA3P42263 894 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA3P43357 314 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FHITP49789 147 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CDH13P55290 713 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 USP41Q3LFD5 358 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC36A4Q6YBV0 504 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MOB2Q70IA6 237 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ILDR2Q71H61 639 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 ZFP82Q8N141 532 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 C22orf15Q8WYQ4 148 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 OR10A4Q9H209 315 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf21Q9H246 121 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PCDH9Q9HC56 1237 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 OR5K4A6NMS3 321 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MYL12BO14950 172 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ABCB7O75027 752 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 METTL18O95568 372 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CSF2P04141 144 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RHOP08100 348 aa5.54□□□□□ -1.52
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