RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 GM2AP17900 193 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 LINGO1Q96FE5 620 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 CFL2Q9Y281 166 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 WNT8BQ93098 351 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SNX6Q9UNH7 406 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 MFSD11O43934 449 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 OTCP00480 354 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 T-ENOLP0DO92 83 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 NMBRP28336 390 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 GRIA1P42261 906 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PPP2R2BQ00005 443 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 FCGR1BQ92637 280 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 YWHAQP27348 245 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 CDH12P55289 794 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 EPGNQ6UW88 154 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 RAD18Q9NS91 495 aa14.52□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF81P51508 661 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 NFATC3Q12968 1075 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 RAB23Q9ULC3 237 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 H0YJX3 145 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 PLOD2O00469 737 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 KLF11O14901 512 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 UBXN8O00124 270 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 B3GAT3O94766 335 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 SLC6A2P23975 617 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 CCR10P46092 362 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 TIGD4Q8IY51 512 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 OR2B3O76000 313 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 IRF8Q02556 426 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 SULT2A1Q06520 285 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 SMCO1Q147U7 214 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 XYLT1Q86Y38 959 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 SLCO2A1Q92959 643 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC58Q96CX6 371 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 USP29Q9HBJ7 922 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 CCL22O00626 93 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 SLC22A2O15244 555 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 LAPTM4AQ15012 233 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 GAB3Q8WWW8 586 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 WACQ9BTA9 647 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 BEX1Q9HBH7 125 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 RHOCP08134 193 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 FGRP09769 529 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 COL6A2P12110 1019 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 OR4A15Q8NGL6 344 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 COQ8AQ8NI60 647 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 TCF25Q9BQ70 676 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 MYH10P35580 1976 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 ODC1P11926 461 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 FBXO32Q969P5 355 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 CCDC120Q96HB5 630 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 CRELD1Q96HD1 420 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 MKLN1Q9UL63 735 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 CYP3A7P24462 503 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 NOS2P35228 1153 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 OPRL1P41146 370 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX1-202ENST00000439984 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms