RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGO1-208	ENST00000437051	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	IPMK	Q8NFU5	416 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	ZMYND15	Q9H091	742 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	SGTA	O43765	313 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	UBXN7	O94888	489 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	AGT	P01019	485 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	ADRA1A	P35348	466 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	SPAM1	P38567	509 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	ATP1A2	P50993	1020 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	SH3BP2	P78314	561 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	GPR18	Q14330	331 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	PID1	Q7Z2X4	250 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	GBA3	Q9H227	469 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	TRABD	Q9H4I3	376 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	IL17B	Q9UHF5	180 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	KCTD3	Q9Y597	815 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	HACD1	B0YJ81	288 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	NKX2-8	O15522	239 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	MTSS1	O43312	755 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	STK17B	O94768	372 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	VIP	P01282	170 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	APOC2	P02655	101 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	F8A1	P23610	371 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	DMPK	Q09013	629 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	MPP3	Q13368	585 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	ODF2	Q5BJF6	829 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	ALG3	Q92685	438 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	TGM7	Q96PF1	710 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	VAT1	Q99536	393 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	POT1	Q9NUX5	634 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	SMOX	Q9NWM0	555 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	ARL5A	Q9Y689	179 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	PJA2	O43164	708 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	SLC28A2	O43868	658 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	HLA-DPA1	P20036	260 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	CAPZB	P47756	277 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	XRCC4	Q13426	336 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	AVL9	Q8NBF6	648 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	ACTL9	Q8TC94	416 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	APOL2	Q9BQE5	337 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	FICD	Q9BVA6	458 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	TRIM5	Q9C035	493 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051		A0A0U1RQJ8	604 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	IDS	P22304	550 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	PTPN7	P35236	360 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	SEPHS1	P49903	392 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	XIAP	P98170	497 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	NFE2L1	Q14494	772 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	RPE65	Q16518	533 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SGO1-208	ENST00000437051	RANBP10	Q6VN20	620 aa		18.15	■□□□□ 0.5

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