RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 STON1Q9Y6Q2 735 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCN8AQ9UQD0 1980 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARCH11A6NNE9 402 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 C4orf47A7E2U8 309 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8SH3BPF8 625 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 P4HA2O15460 535 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED7O43513 233 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACSL4O60488 711 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERN1O75460 977 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLV3-27P01718 113 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOEP02649 317 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FYNP06241 537 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CISD3P0C7P0 127 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF806P0C7X5 589 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDGFRAP16234 1089 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF20P17024 532 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENGP17813 658 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PON1P27169 355 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHKAP35790 457 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSKP41240 450 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPD2P43304 727 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF4P43489 277 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD8P48556 350 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SULT1E1P49888 294 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 COPAP53621 1224 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRX4P78413 519 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MXRA7P84157 204 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP8P85298 464 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MC2RQ01718 297 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMAN2Q12907 356 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NME3Q13232 169 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 POM121L1PQ3SYA9 428 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPN20Q4JDL3 420 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPPE1Q53F39 396 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCAF6Q58WW2 860 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM209BQ5JX69 171 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIIPQ5JXC2 388 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYPL2Q5VXT5 272 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6B2Q6IFH4 312 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM114A1Q8IWE2 563 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LGI2Q8N0V4 545 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPXM2Q8N436 756 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB124Q8NES8 71 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC26Q8TAB7 109 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 UCMAQ8WVF2 138 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHC3Q92529 594 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NACC2Q96BF6 587 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINB11Q96P15 392 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GABRG3Q99928 467 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTKNQ9BST9 563 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR174Q9BXC1 333 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTYH3Q9C0H2 523 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS16Q9H269 839 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LHX5Q9H2C1 402 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDCL3Q9H2J4 239 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 THAP9Q9H5L6 903 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM9BQ9NQ34 198 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM74BQ9NUR3 256 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJC12Q9UKB3 198 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMTF1Q9Y222 760 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX10Q9Y5X0 201 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACACAQ13085 2346 aa4.52□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAGE12BA1L429 117 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms