RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 AGTP01019 485 aa26.78■■□□□ 1.88
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LMO1-202ENST00000428101 PLXDC1Q8IUK5 500 aa26.78■■□□□ 1.88
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LMO1-202ENST00000428101 FAM118BQ9BPY3 351 aa26.74■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 ZPBPQ9BS86 351 aa26.74■■□□□ 1.87
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LMO1-202ENST00000428101 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 TMEM220Q6QAJ8 160 aa26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 AMZ2Q86W34 360 aa26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 LRRC57Q8N9N7 239 aa26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 ACRBPQ8NEB7 543 aa26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 TGM7Q96PF1 710 aa26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
LMO1-202ENST00000428101 SMOXQ9NWM0 555 aa26.73■■□□□ 1.87
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